图解B树及C#实现(1)

2023年 9月 28日 61.8k 0

前言

B树(B-tree),也常被记作 B-树,其中“-”不发音。B树的发明者 Rudolf Bayer 和 Edward M. McCreight 并没有给B树中的 B 明确的定义,大家也不必对此纠结太多。

B+树是B树的变体,两者的适用场景是不一样的,以后也会给大家带来B+树的介绍。

本系列将用三篇文章讲解B树的设计理念及如何用 C# 实现一个内存版本的B树:

  • B树的定义及数据的插入(本文)
  • 数据的读取及遍历
  • 数据的删除
  • 完整代码已放至github github.com/eventhorizo…
    或者安装 nuget 包进行体验

    dotnet add package EventHorizon.BTree
    

    完整代码中包含了debug辅助代码,可以通过调试来了解B树的内部结构。

    B树最早被设计出来,并不是作为一个单纯的内存数据结构,而是用作 磁盘存储引擎 的索引实现,以后也会单独写一篇文章来做说明。

    本文部分说明引用自PingCAP 的公开ppt 宝宝床边故事集:存储引擎,强烈推荐给各位学习。

    部分内容属于个人理解,若有不对之处,欢迎指正。

    索引原理

    局部性(Locality)

    硬件、操作系统等等系统,绝大部分时候,执行一次操作流程 有额外的开销(overhead)。

    因此很多部件、模块都设计成:连续执行类似或相同的操作、访问空间相邻的内容时,则将多次操作合并为一次,或多次之间共享上下文信息。这样能极大提升性能。

    这种时间、空间上的连续性,叫做局部性。

    数据的局部性

    我们把数据的连续性及连续区域大小称为 局部性,连续存放的数据越多,局部性越好。

    内存存储和磁盘存储

    IO的访问性能有两个重要的衡量指标:

  • IOPS(Input/Output Operations Per Second): 每秒进行IO读写操作的次数
  • IOBW(Input/Output Bandwidth): IO带宽
  • 磁盘的IOPS和IOBW都低于内存,IOPS更为明显。

    磁盘IO是以 页(page)为单位进行数据读取的,如果数据的局部性好,只加载一个磁盘页到内存就可以实现一组有序数据的连续访问。如果数据的局部性差,则每读取一次数据都有可能要加载一个磁盘页,性能较差。

    当数据局部性差时:

    • 需要更频繁地访问磁盘
    • IOPS 比 IOBW 先达到上限,性能差

    当数据局部性好时:

    • IOBW 能达到硬件上限
    • IOBW 达到上限是理想的最好性能

    磁盘存储适合的索引结构

    综上所述,就磁盘存储而言,局部性的好坏对性能影响很大。

    有序数组的局部性很好,用二分查找法查询数据的时间复杂度是O(log n)。但插入数据时,时间复杂度就成了O(n)。

    二叉平衡树(Self-balancing binary search tree,常见的实现如 AVL树 和 红黑树)用二分查找法查询数据的时间复杂度是O(log n)。插入数据时也是先查询到具体位置,时间复杂度是O(log n)。

    但二叉平衡树的局部性很差,这在内存中不是什么问题,因为内存访问随机数据的性能很高,但在磁盘中,不断加载不同的磁盘页,overhead 很高。

    数据的局部性越好,读性能更好,但写性能会降低。
    数据的局部性越差,读性能会变差,但写性能会更好。

    B树则是在这两者之间寻求平衡点:

    从有序数组的角度看,我们把大数组分割成了一个个小的有序数组,再用另一种有序结构把小数组组织起来,插入数据时,移动数据量减少并且可控。

    从树的角度看,用一个个小的有序数组代替元素作为节点,大大增加了局部性,减少了存储 overhead。

    B树简介

    定义

    B树中的节点分为三种:

    • 根节点(root node)
    • 内部节点(internal node):存储数据以及指向其子节点的指针。
    • 叶子节点(leaf node):叶子节点只存储数据,没有子节点。

    B树只有一个节点时,根节点本身就是叶子节点。

    节点中每一个数据项(下文用 item 代替)都是一组键值对。item 的数量范围需要预定义,通常有以下两种定义方式:

    • 度(degree):通常简写为 t,2t-1 代表 item 数量上限。
    • 阶(order):通常简写为 m,m 代表 item 数量上限。

    本文用 度(degree)进行描述,一个度是 t(t>=2) 的B树被设计为具有以下属性:

  • 每一个非根节点拥有的键的数量在 [t-1, 2t-1] 之间。
  • 每一个节点最多有 2t 个子节点。
  • 每一个内部节点最少有 t 个子节点。
  • 如果根节点不是叶子节点,那么它至少有两个子节点。
  • 有 k 个子节点的非叶子节点拥有 k − 1 个键。
  • 所有的叶子节点都在同一层。
  • 这5个属性都是为了维持B树的平衡。其中前5个是在 度 被定义后就可以控制的,而第6个是源于B树新增数据的方式,稍后会做解释。

    B树中数据的有序性

    • 每个 节点 中的 Item 按 Key 有序排列(规则可以是自定义的)。
    • 升序排序时,每个 Item 左子树 中的 Item 的 Key 均小于当前 Item 的 Key。
    • 升序排序时,每个 Item 右子树 中的 Item 的 Key 均大于当前 Item 的 Key。

    用C#定义数据结构

    开始算法讲解前,我们需要先定义下将会用到的数据结构。

    虽然代码太多可能影响阅读体验,但考虑到 gayhub 可能访问不稳定,还是尽量贴全了。

    下图所示是一个 degree 是 3 的 B树,Key 按升序排序。

    internal class Item
    {
        #region Constructors
    
        public Item(TKey key, TValue? value)
        {
            Key = key;
            Value = value;
        }
    
        #endregion
    
        #region Properties
    
        public TKey Key { get; }
    
        public TValue? Value { get; set; }
        
        #endregion
    }
    

    定义 ItemsChildren 两个类型分别用于存储 Item 集合和子节点集合。为了简化设计以及减少动态扩容带来的性能损失,作为数据实际容器的数组在第一开始就会按最大的 capacity 进行创建。同时也预先给 ItemsChildren 定义好后面会被用到的基本方法。

    internal class Items
    {
        #region Fields
    
        private readonly Item?[] _items;
        private readonly int _capacity;
        private readonly IComparer _comparer;
    
        private int _count;
    
        #endregion
    
        #region Constructors
    
        public Items(int capacity, IComparer comparer)
        {
            _capacity = capacity;
            _items = new Item[capacity];
            _comparer = comparer;
        }
    
        #region Properties
    
        public int Count => _count;
    
        #endregion
    
        #region Indexers
    
        public Item this[int index]
        {
            get
            {
                if (index = _count)
                {
                    throw new IndexOutOfRangeException();
                }
    
                return _items[index]!;
            }
            set => _items[index] = value;
        }
    
        #endregion
    
        #endregion
    
        #region Public Methods
    
        /// 
        /// 查找指定的键,并返回它的索引,如果找不到则返回key可以插入的位置
        /// 
        /// 指定的key
        /// key的索引或者其可以插入的位置
        /// 指定的key是否存在
        public bool TryFindKey(TKey key, out int index)
        {
            if (_count == 0)
            {
                index = 0;
                return false;
            }
    
            // 二分查找
            int left = 0;
            int right = _count - 1;
            while (left  InsertAt(_count, item);
    
        public void AddRange(Items items)
        {
            if (_count + items.Count > _capacity)
                throw new InvalidOperationException("Cannot add items to a full list.");
    
            Array.Copy(items._items, 0, _items, _count, items.Count);
            _count += items.Count;
        }
    
        public Item RemoveAt(int index)
        {
            if (index >= _count)
                throw new ArgumentOutOfRangeException(nameof(index));
    
            var item = _items[index];
    
            if (index  RemoveAt(_count - 1);
    
        public void Truncate(int index)
        {
            if (index >= _count)
                throw new ArgumentOutOfRangeException(nameof(index));
    
            for (int i = index; i < _count; i++)
            {
                _items[i] = null;
            }
    
            _count = index;
        }
    
        #endregion
    }
    
    internal class Children
    {
        #region Fields
    
        private readonly Node?[] _children;
        private readonly int _capacity;
    
        private int _count;
    
        #endregion
    
        #region Constructors
    
        public Children(int capacity)
        {
            _capacity = capacity;
            _children = new Node[_capacity];
        }
    
        #endregion
    
        #region Properties
    
        public int Count => _count;
    
        #endregion
    
        #region Indexers
    
        public Node this[int index]
        {
            get
            {
                if (index = _count)
                {
                    throw new IndexOutOfRangeException();
                }
    
                return _children[index]!;
            }
        }
    
        #endregion
    
        #region Public Methods
    
        public void InsertAt(int index, Node child)
        {
            if (_count == _capacity)
                throw new InvalidOperationException("Cannot insert into a full list.");
    
            if (index  InsertAt(_count, child);
    
        public void AddRange(Children children)
        {
            if (_count + children.Count > _capacity)
                throw new InvalidOperationException("Cannot add to a full list.");
    
            Array.Copy(children._children, 0, _children, _count, children.Count);
            _count += children.Count;
        }
    
        public Node RemoveAt(int index)
        {
            if (index >= _count)
                throw new ArgumentOutOfRangeException(nameof(index));
    
            var child = _children[index];
    
            if (index  RemoveAt(_count - 1);
    
        public void Truncate(int index)
        {
            if (index >= _count)
                throw new ArgumentOutOfRangeException(nameof(index));
    
            for (var i = index; i < _count; i++)
                _children[i] = null;
    
            _count = index;
        }
    
        #endregion
    }
    

    Node 来表示每个节点,支持传入 Comparer 用于实现自定义的排序方式。

    internal class Node
    {
        #region Fields
    
        private readonly IComparer _comparer;
        private readonly int _degree;
        private readonly int _minItems;
        private readonly int _maxItems;
        private readonly int _maxChildren;
    
        private readonly Items _items;
        private readonly Children _children;
    
        #endregion
    
        #region Constructors
    
        public Node(int degree, IComparer comparer)
        {
            _degree = degree;
            _comparer = comparer;
            _minItems = degree - 1;
            _maxItems = 2 * degree - 1;
            _maxChildren = 2 * degree;
    
            _items = new Items(_maxItems, _comparer);
            _children = new Children(_maxChildren);
        }
    
        #endregion
    
        #region Properties
    
        public int ItemsCount => _items.Count;
    
        public int ChildrenCount => _children.Count;
    
        public bool IsItemsFull => ItemsCount == _maxItems;
        public bool IsItemsEmpty => ItemsCount == 0;
    
        public bool IsLeaf => ChildrenCount == 0;
    
        #endregion
    
        // ...
    }
    
    public sealed class BTree : IEnumerable
    {
        #region Fields
    
        private readonly int _degree;
        private readonly IComparer _comparer;
        private int _count;
        private Node? _root;
    
        #endregion
    
        #region Constructors
    
        public BTree(int degree) : this(degree, Comparer.Default)
        {
        }
    
        public BTree(int degree, IComparer comparer)
        {
            if (degree  _count;
    
        public int Degree => _degree;
    
        public IComparer Comparer => _comparer;
    
        #endregion
    
        // ...
    }
    

    插入数据的过程

    先重复一下上文提到的B树的顺序特性:

    • 每个 节点 中的 Item 按 Key 有序排列(规则可以是自定义的)。
    • 升序排序时,每个 Item 左子树 中的 Item 的 Key 均小于当前 Item 的 Key。
    • 升序排序时,每个 Item 右子树 中的 Item 的 Key 均大于当前 Item 的 Key。

    插入数据的过程就是在树中找到合适的位置插入数据,同时保证树的顺序特性不变。

    寻找位置的过程是递归的,从根节点开始,如果当前节点是叶子节点,那么就在当前节点中插入数据;如果当前节点不是叶子节点,那么就根据当前节点中的 Item 的 Key 和要插入的数据的 Key 的大小关系,决定是向左子树还是右子树继续寻找合适的位置。

    以下面这个图例来说明插入数据的过程:

  • 在 根节点 中,借助 二分查找法 找到 5 的位置应该在 3 和 7 之间,因为根节点不是叶子节点,所以不能在根节点直接插入,继续在 Node 2 中寻找合适的位置。Node 2 是 3 的右子树,7 的左子树,其中的 Key 都大于 3,小于 7。
  • Node 2 是叶子节点,所以可以在 Node 2 中插入 5。按二分查找法找到 5 的位置应该在 4 和 6 之间,所以插入数据后 Node 2 中的 Item 应该是这样的:[4, 5, 6]
  • 分裂:新节点诞生的唯一方式

    上文提到单个节点最多只能有 2t-1 个 Item,如果节点已经满了,还有新 Item 需要插入的话,节点就需要进行分裂。

    根节点的分裂

    如果根节点满了(Item的数量达到2t-1),有需要插入新 Item 的话,就需要对根节点进行分裂,分裂后的根节点会有两个子节点,分别是原来的根节点和新的节点。

    分裂分为以下几个步骤(不一定要按这个顺序):

  • 创建一个新的节点,作为新的根节点。
  • 将原根节点作为新根节点的第一个子节点。
  • 将原根节点中间(索引记为mid)的 Item 移动到新的根节点中,作为新根节点的第一个 Item。
  • 创建一个新的节点。
  • 将原根节点中间 Item 右边的 Item(mid+1开始)移动到新节点中。
  • 将原根节点中间 Item 右边的 子节点(mid+1开始)移动到新节点中。
  • 将新节点作为新根节点的第二个子节点。
  • 非根节点的分裂

    假设当前节点是父节点的第 k 个子节点,也就是父节点 Items[k](用PItems代指) 的左子节点,或者说是PItems[k-1] 的右子节点。当前节点中所有 Item 的 Key 都在 (PItems[k-1], PItems[k])区间内。

    分裂分为以下几个步骤:

  • 将中间(索引记为mid)的 Item (记作MItem)提升到父节点中,插入 PItems[k],原来的 PItems[k] 移动至 PItems[k+1],父节点中的 Item 依然保持有序。
  • 创建新的节点。
  • 将右半部分(mid+1开始)的 Item 移至新节点。
  • 将右半部分(mid+1开始)的 子节点 移至新节点。
  • 将新的节点 插入父节点的子节点的第 k+1 个位置,也就是作为刚改过位置的 MItem 的右子节点,MItem 的 Key 小于 其右子树中所有 Item,顺序性也不会遭到破坏。
  • 新插入的 Item 会根据 Key 的大小,插入到分裂后的左节点或者右节点中。

    下图所示B树 degree 为 3,每个 Node 最多有 5(2*3-1)个 Item,在[4,5,6,8,9]所在节点插入 7 需先进行分裂。6 将被提升到根节点中,原来的 6 所在节点将被分裂成两个节点,7 会被插入到右侧的新节点中。

    分裂导致树的高度增加

    节点在分裂的时候,如果父节点已经满了,那么父节点也需要分裂,这样就会导致父节点的父节点也需要分裂,以此类推,直到根节点。

    而根节点的分裂,会导致树的高度增加。

    新 Item 的插入是发生在叶子节点的,分裂也是从叶子节点开始。如果一个节点一开始是叶子节点,随着数据的增加,它始终都是叶子节点,叶子节点分裂后,新的叶子节点也是同一高度的。

    这其实解答了上文提到的问题:为什么B树的叶子节点都在同一层。

    提前分裂

    B树中数据的插入过程,是一个从根节点不断 向下 寻找合适叶子节点的过程。

    而分裂是一个从叶子节点不断 向上 的过程。

    因此分裂算法的实际实现中,为了避免回溯性分裂(磁盘存储中,回溯带来的 overhead 很大),一般会在 向下 寻找的过程中提前去分裂已经满了的节点。

    插入算法实现

    在插入新 Item 的过程中,BTree 本质上只是一个入口,大部分的逻辑都是和 节点 相关的,因此我们会把主要的逻辑定义在 节点 中。

    Key 已存在时的处理策略

    新插入的 Item 的 Key 可能已经存在了,针对已经存在的 Key 的处理方式,这边参考 Dictionary 的处理方式:

    • 通过 Indexer 插入数据时新 Value 覆盖旧 Value。
    • 通过 Add 插入数据时扔出异常。
    • 通过 TryAdd 插入数据时不作任何处理。

    对应枚举如下:

    internal enum InsertionBehavior
    {
        /// 
        /// 默认操作,如果 key 已经存在,则不会更新 value
        /// 
        None = 0,
    
        /// 
        /// 如果 key 已经存在,则更新 value
        /// 
        OverwriteExisting = 1,
    
        /// 
        /// 如果 key 已经存在,则抛出异常
        /// 
        ThrowOnExisting = 2
    }
    

    并定义对应的处理结果枚举

    internal enum InsertionResult
    {
        None = 0,
        Added = 1,
        Updated = 2,
    }
    
    public sealed class BTree : IEnumerable
    {
        #region Indexers
    
        public TValue? this[[NotNull] TKey key]
        {
            get
            {
                if (TryGetValue(key, out var value))
                {
                    return value;
                }
    
                throw new KeyNotFoundException();
            }
            set => TryInsert(key, value, InsertionBehavior.OverwriteExisting);
        }    
    
        #endregion
    
        #region Public Methods
    
        /// 
        /// 往B树中添加一个键值对
        /// 
        /// 要添加的元素的key
        /// 要添加的元素的value
        /// key是null
        /// key已经存在
        public void Add([NotNull] TKey key, TValue? value) =>
            TryInsert(key, value, InsertionBehavior.ThrowOnExisting);
    
        /// 
        /// 尝试往B树中添加一个键值对
        /// 
        /// 要添加的元素的key
        /// 要添加的元素的value
        /// true:添加成功;false:添加失败
        public bool TryAdd([NotNull] TKey key, TValue? value) =>
            TryInsert(key, value, InsertionBehavior.None);
    
        #endregion
    }
    

    插入算法

    在 Node 中 定义分裂和判断是否要提前分裂的方法

    internal class Node
    {
        /// 
        /// 将当前分裂成两个。
        /// 
        /// 中间位置的和分裂后的第二个
        public (Item MiddleItem, Node SecnodNode) Split()
        {
            int middleIndex = ItemsCount / 2;
            var middleItem = _items[middleIndex];
            var secondNode = new Node(_degree, _comparer);
    
            // 将中间位置后的所有Item移动到新的Node中
            for (int i = middleIndex + 1; i < ItemsCount; i++)
            {
                secondNode._items.Add(_items[i]);
            }
    
            _items.Truncate(middleIndex);
    
            if (!IsLeaf)
            {
                // 将中间位置后的所有子节点移动到新的Node中
                for (int i = middleIndex + 1; i  插入到当前节点中。
        /// 
        /// 指定的子节点的索引
        /// True 表示已经分裂了子节点,False 表示没有分裂子节点
        private bool MaybeSplitChildren(int childIndex)
        {
            var childNode = _children[childIndex];
            if (childNode.IsItemsFull)
            {
                var (middleItem, secondNode) = childNode.Split();
                _items.InsertAt(childIndex, middleItem);
                // 将新node插入到当前node的children中
                _children.InsertAt(childIndex + 1, secondNode);
                return true;
            }
    
            return false;
        }
    }
    

    在 BTree 中定义插入方法

    public sealed class BTree
        private bool TryInsert([NotNull] TKey key, TValue? value, InsertionBehavior behavior)
        {
            ArgumentNullException.ThrowIfNull(key);
    
            if (_root == null)
            {
                _root = new Node(_degree, _comparer);
                _root.Add(new Item(key, value));
                _count++;
                return true;
            }
    
            if (_root.IsItemsFull)
            {
                // 根节点已满,需要分裂
                var (middleItem, secondNode) = _root.Split();
                var oldRoot = _root;
                _root = new Node(_degree, _comparer);
                // 将原来根节点中间的元素添加到新的根节点
                _root.Add(middleItem);
                // 将原来根节点分裂出来的节点添加到新的根节点
                _root.AddChild(oldRoot);
                _root.AddChild(secondNode);
            }
    
            // 从根节点开始插入,如果插入的 Key 已经存在,会按照 behavior 的值进行处理
            var insertionResult = _root.TryInsert(key, value, behavior);
            if (insertionResult == InsertionResult.Added) _count++;
    
            return insertionResult != InsertionResult.None;
        }
    }
    

    在 Node 中定义插入方法,递归调用直至找到叶子节点,然后在叶子节点中插入

    internal class Node
    {
        public InsertionResult TryInsert(TKey key, TValue? value, InsertionBehavior behavior)
        {
            // 如果当前key已经存在, 根据插入行为决定是否替换
            if (_items.TryFindKey(key, out int index))
            {
                switch (behavior)
                {
                    case InsertionBehavior.OverwriteExisting:
                        _items[index].Value = value;
                        return InsertionResult.Updated;
                    case InsertionBehavior.ThrowOnExisting:
                        throw new ArgumentException($"An item with the same key has already been added. Key: {key}");
                    default:
                        return InsertionResult.None;
                }
            }
    
            // 如果当前节点是叶子节点,则直接插入
            if (IsLeaf)
            {
                // index 是新的 item 应该插入的位置,items 按顺序排列
                _items.InsertAt(index, new Item(key, value));
                return InsertionResult.Added;
            }
    
            // 如果当前节点的子节点已经满了,则需要分裂
            // 如果当前节点的子节点没有满,则不需要分裂
            // 如果当前节点的子节点分裂了,则需要判断当前key是否大于分裂后的中间key
            // 如果当前key大于分裂后的中间key,则需要向右边的子节点插入
            // 如果当前key小于分裂后的中间key,则需要向左边的子节点插入
    
            // index 是新的 item 应该插入的位置,如果当做children的索引,则代表应该插入的位置的右边的子节点
            if (MaybeSplitChildren(index))
            {
                // rightmostItem 是子节点分裂后的中间的 item,被提升到当前节点的 items 中的最后一个位置了
                var middleItemOfChild = _items[index];
    
                switch (_comparer.Compare(key, middleItemOfChild.Key))
                {
                    case > 0:
                        // 如果当前key大于分裂后的中间key,则需要向右边的子节点插入
                        index++;
                        break;
                    case < 0:
                        // 如果当前key小于分裂后的中间key,则需要向左边的子节点插入
                        break;
                    default:
                        // 如果当前key等于分裂后的中间key,根据插入行为决定是否替换
                        switch (behavior)
                        {
                            case InsertionBehavior.OverwriteExisting:
                                middleItemOfChild.Value = value;
                                return InsertionResult.Updated;
                            case InsertionBehavior.ThrowOnExisting:
                                throw new ArgumentException(
                                    $"An item with the same key has already been added. Key: {key}");
                            default:
                                return InsertionResult.None;
                        }
                }
            }
    
            // 往子节点插入
            return _children[index].TryInsert(key, value, behavior);
        }
    }    
    

    总结

    B树中的数据是按照顺序存储的,所以可以使用二分查找法来查找数据,时间复杂度为 O(log n)。

    往B树插入数据的过程是一个寻找合适的叶子节点的过程,然后在叶子节点中插入数据,时间复杂度为 O(log n)。

    B树的节点中存储的数据量是有限的,所以在插入数据时,可能会发生节点分裂,这样就会导致树的高度增加,所以在插入数据时,需要判断是否需要分裂,如果需要分裂,就需要将中间的数据提升到父节点中,以此类推,直到根节点,如果根节点也需要分裂,就需要新建一个根节点,然后将原来的根节点和分裂出来的节点作为新的根节点的子节点。

    参考资料

    PingCAP 宝宝床边故事集:存储引擎

    B树、B+树索引算法原理(上)

    B树 维基百科

    Google 用 Go 实现的内存版 B树

    渴望力量系列 《算法导论第三版》

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