Node.js工程中的依赖包管理方式通常使用npm（Node Package Manager）或者Yarn。
npm是Node.js官方提供的默认包管理工具，它允许开发者在项目中声明、安装和管理依赖包。npm提供了一个庞大的包仓库，开发者可以从中获取开源的Node.js模块和库，并将其添加到自己的项目中。使用npm进行依赖管理非常简单，只需在项目根目录下创建一个package.json文件，然后在其中声明所需的依赖包及其版本号。npm会根据package.json中的依赖信息自动下载和安装所需的包，并将它们保存在项目的node_modules目录中。开发者可以使用npm命令来执行各种操作，例如安装依赖、更新依赖、卸载依赖等。
Yarn是由Facebook开发的另一种包管理工具，它在性能和安全性方面相对于npm有一些改进。Yarn使用一个名为yarn.lock的文件来确保项目的依赖包在不同开发环境中的一致性。类似于npm，开发者可以在项目根目录下创建一个package.json文件来声明依赖信息，然后使用yarn命令进行包的安装、更新和卸载操作。Yarn还支持并行安装依赖包，这可以提高安装速度。
综上所述，Node.js工程中的依赖包管理方式主要是通过npm或Yarn进行管理。这些工具提供了便捷的命令行界面和功能，使开发者能够轻松地管理项目的依赖关系，并且它们被广泛应用于Node.js生态系统中，为开发者提供了丰富的开源资源和模块。
